Fußnoten mit und ohne Zotero

Liebe Community,

In einer Arbeit belege ich sehr viele Textstellen mit Archivalien, die nicht im Literaturverzeichnis auftauchen und nach einer anderen Logik als Sekundärliteratur angeben werden. Deswegen wollte ich gerne zum einen Fußnoten von Hand für die Quellen und zum anderen Fußnoten über Zotero für die Sekundärliteratur verwenden.
Kann das zu Problemen führen (etwa bei der fortlaufenden Nummerierung der Fußnoten, Formatierung, etc.) oder könnte dies eine gut durchführbare Variante sein?

Danke im Voraus!
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